总经理在处理同部门经理的关系上应该做到：
1. 尊重部门经理的职权，不越俎代庖，不随便插手部门的工作。
2. 尊重部门经理的劳动，正确下达各种指令，避免瞎指挥
3. 严格管理，赏罚分明，公正待人。
4. 支持部门经理的工作，主动帮助他们解决各种难题。
5. 注意在实践中培养部门经理的管理才能，并给他们创造必要的培训机会。
6. 尊重部门经理的人格，理解他们的苦衷，关心他们的生活。